该病一般发生在果实长至核桃大时。最初表现为脐部出现水浸状病斑，后逐渐扩大，致使果实顶部凹陷、变褐；发病的果实多发生在第1、2穗果实上，这些果实往往长不大，发硬，提早变红。

1、土壤钙元素较少，又没有补充钙肥，尤其是可溶性的钙不足时，容易发病。

2、水肥易流失的田块容易发病，比如土壤板结的地块、坡度大的地块等。

3、土壤质地也是发病的一个条件，比如沙土地、盐碱地等，就很容易发病。

4、在番茄开花结果期，天气出现干旱，又没有及时灌溉的情况，也容易发病。

5、追肥过晚（尤其是钙肥）或者追肥过量时，也是发病脐腐病的一个条件。